一、慶功宴后的野心火苗
論文見刊那天，302實驗室罕見地提前下了班。林卷卷抱著剛打印出來的論文單行本，非要拉著江硯去學校門口的麻辣燙店“慶功”。
“江博士，你看這紅湯多像我們飆升的影響因子！”林卷卷舉著筷子，把一串魚丸浸在滾燙的紅油里，“二區(qū)頂刊只是開胃菜，下次我們直接上CNS豪華套餐！”
江硯看著她被辣得通紅的鼻尖，默默遞過一杯冰可樂：“先吃你的魚丸?！彼焐喜懖惑@，指尖卻在桌下摩挲著手機——屏幕上是Nature最新一期的目錄，其中一篇關于單細胞空間轉(zhuǎn)錄組的論文，被他標了三個醒目的紅圈。
“說真的，”林卷卷吸溜著面條，突然正經(jīng)起來，“Dragon-Seq 2.0雖然牛，但總覺得還差口氣。就像打游戲通關了普通難度，不試試地獄模式怎么甘心？”
江硯抬眼，眼底閃過一絲笑意：“如果我說，有個方向可能打敗現(xiàn)有單細胞分析的范式，難度系數(shù)堪比同時解十道NP難題，你敢不敢接？”
“接！”林卷卷想都沒想就拍了桌子，麻辣燙的湯汁濺到白大褂上也毫不在意，“只要能發(fā)Nature，別說NP難題，讓我給測序儀唱《征服》都行！”
那天晚上，兩人踩著月光走回實驗室。林卷卷拿著根樹枝當劍，邊比劃邊喊：“Nature副本，我林卷卷來啦！小怪們接招！”江硯跟在她身后，聽著她把頂級期刊比作游戲副本，突然覺得那座遙不可及的學術(shù)高峰，似乎也沒那么陡峭了。
二、實驗室黑板上的狂想曲
第二天一早，林卷卷剛沖進實驗室，就被黑板上的內(nèi)容驚得差點咬掉舌頭。
原本干凈的黑板上，被江硯用白色粉筆寫滿了公式和示意圖：從單細胞測序數(shù)據(jù)的時間序列建模，到空間位置信息的整合算法，再到與蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡的動態(tài)關聯(lián)……最后用紅色粉筆圈出三個大字：時空圖譜。
“這、這是……”林卷卷指著黑板，結(jié)結(jié)巴巴地說不出話。
“單細胞時空動態(tài)圖譜?！苯幉亮瞬潦稚系姆酃P灰，語氣平靜得像在說今天的天氣，“現(xiàn)有技術(shù)能測單細胞的基因表達，能看空間位置，卻沒法把時間維度加進去——細胞是怎么從胚胎干細胞分化成神經(jīng)細胞的？腫瘤細胞在體內(nèi)遷移時基因表達如何變化？這些動態(tài)過程，我們現(xiàn)在只能靠推測?！?/p>
他拿起粉筆，在“時空圖譜”旁邊畫了個簡單的坐標軸：“橫軸是空間位置，縱軸是基因表達，第三軸是時間。我們要做的，就是用算法給細胞‘拍電影’，讓它的每一個變化都無所遁形。”
林卷卷的眼睛越睜越大，手里的早餐面包“啪嗒”掉在地上：“這、這要是做出來，豈不是能直接看到細胞的‘前世今生’？”
“不止。”江硯的指尖點在黑板上的一個節(jié)點，“如果能實現(xiàn)，癌癥轉(zhuǎn)移機制、胚胎發(fā)育奧秘、甚至神經(jīng)退行性疾病的病程進展，都可能被重新定義。”
林卷卷突然撲到黑板前，拿起紅色粉筆在“時空圖譜”下方畫了個大大的游戲手柄，旁邊寫著：SCI大富翁之Nature副本開荒計劃——主線任務：解鎖細胞時空密碼。
“江博士，”她轉(zhuǎn)過身，眼睛亮得像藏了整片星空，“這副本，我跟你刷了！”
江硯看著黑板上嚴肅的科學構(gòu)想和幼稚的游戲涂鴉奇妙共存，嘴角的弧度再也藏不住。他拿起黑板擦，卻沒有擦掉那個游戲手柄，只是輕聲說：“先說好，這個副本的BOSS比你想象的難打?！?/p>
三、第一關：數(shù)據(jù)海嘯與代碼防線
開荒計劃啟動的第一周，林卷卷就體會到了“Nature副本”的下馬威——數(shù)據(jù)量。
為了構(gòu)建時空圖譜，他們需要整合三種數(shù)據(jù)：單細胞測序的基因表達矩陣（動輒幾十GB）、空間轉(zhuǎn)錄組的位置信息（三維坐標點云數(shù)據(jù)）、以及顯微鏡拍攝的時間序列影像（每小時產(chǎn)生200GB原始數(shù)據(jù)）。
“這哪是數(shù)據(jù)啊，這是海嘯！”林卷卷盯著服務器的存儲容量報警界面，哀嚎著癱在椅子上，“我們現(xiàn)有的算力，處理這些數(shù)據(jù)就像用算盤解微積分！”
江硯正在調(diào)試新到的超算節(jié)點，聞言回頭：“我申請了學校的GPU集群資源，但調(diào)度優(yōu)先級不夠。需要優(yōu)化算法，把數(shù)據(jù)壓縮到現(xiàn)有算力能啃得動的程度?！?/p>
“壓縮？”林卷卷突然坐直，眼睛一轉(zhuǎn)，“有了！我可以用Transformer模型做特征提取，就像給數(shù)據(jù)‘脫水’！保留精華，丟掉雜質(zhì)！”
她撲到電腦前，手指在鍵盤上翻飛，屏幕上跳出一行行代碼：“你看，把基因表達矩陣當成‘文本’，空間位置當‘上下文’，時間序列當‘語序’……說不定能訓練出個‘細胞語言翻譯器’！”
江硯湊過去看，發(fā)現(xiàn)她竟把自然語言處理的思路嫁接到了生物數(shù)據(jù)上。那些原本雜亂無章的數(shù)據(jù)，在她的算法里被賦予了“語義”，冗余信息被精準剔除，數(shù)據(jù)量瞬間壓縮到原來的1/5。
“邏輯……居然能自洽?！苯庪y得沒吐槽，指尖輕輕點在屏幕上的一個函數(shù)，“這里加個注意力掩碼，讓模型更關注時間維度的變化?！?/p>
林卷卷立刻照做，代碼運行的進度條飛速推進。當最終的壓縮率顯示為19.7%時，兩人對視一眼，都從對方眼里看到了興奮。
“第一關，通關！”林卷卷比了個勝利手勢，突然想起什么，“對了，這模型叫什么名字好？‘細胞壓縮餅干’？還是‘時空脫水機’？”
江硯：“……叫‘Temporal-Seq’?！?/p>
四、閻王爺?shù)睦涑芭c內(nèi)部的熱望
他們要沖擊Nature的消息，不知怎么傳到了閻正明耳朵里。某天組會結(jié)束，閻正明特意路過302實驗室，陰陽怪氣地敲了敲門框。
“小江啊，有志向是好的，但也別好高騖遠?！彼沉搜酆诎迳系摹皶r空圖譜”，嘴角撇出一絲嘲諷，“Nature可不是二區(qū)期刊，不是靠點小聰明就能混進去的?！?/p>
趙宇跟在后面，假惺惺地附和：“就是啊江師弟，聽說你們連超算資源都申請不到？要不我跟閻老師說說，把我們組淘汰的舊服務器借給你們？”
林卷卷正調(diào)試著算法，聞言直接懟回去：“舊服務器就留給趙師兄當游戲機吧，我們的代碼怕它跑起來自燃。”
江硯按住想沖上去理論的林卷卷，對閻正明說：“多謝導師關心，我們會按計劃推進?！?/p>
閻正明見沒討到便宜，悻悻地走了。林卷卷氣得直跺腳：“他分明就是怕我們超過他！”
“所以才要更努力?！苯幋蜷_數(shù)據(jù)文件夾，“你看，張院士把他珍藏的小鼠胚胎發(fā)育數(shù)據(jù)集借給我們了?！?/p>
林卷卷湊過去，看到文件夾里的實驗記錄密密麻麻，標注著“2010-2023”：“張院士也太給力了吧！”
“他說，”江硯頓了頓，語氣里帶著不易察覺的鄭重，“龍騰大學該有篇能讓世界記住的Nature了。”
那天下午，計算機系的教授聽說了他們的計劃，主動派來兩個博士生幫忙優(yōu)化代碼；生科院的技術(shù)員偷偷塞給林卷卷一把細胞房的備用鑰匙：“凌晨三點的顯微鏡沒人搶，你們盡管用?！?/p>
實驗室的黑板上，除了“時空圖譜”，漸漸多了些歪歪扭扭的留言：
“加油！等你們上Nature封面！”（來自隔壁實驗室的師妹）
“代碼有bug可以找我，免費！”（計算機系學霸）
“這是我珍藏的咖啡因片，熬夜必備！”（某不知名的熱心同學）
林卷卷看著那些暖心的字跡，突然覺得，這場Nature副本的開荒，他們不是孤軍奮戰(zhàn)。
五、深夜的泡面與星空
為了趕在國際單細胞大會前拿出初步成果，兩人幾乎住在了實驗室。凌晨三點的302，永遠亮著兩盞燈：江硯那邊是顯微鏡的冷光，林卷卷這邊是電腦屏幕的藍光。
某個深夜，林卷卷的代碼突然跑出一組奇怪的結(jié)果——小鼠胚胎干細胞在分化過程中，某個基因的表達模式呈現(xiàn)出周期性波動，像一串神秘的密碼。
“江博士！你快看這個！”她舉著電腦沖到細胞房，江硯正在給樣本染色，聞言立刻放下移液槍。
屏幕上的折線圖像跳動的心臟，在時間軸上畫出優(yōu)美的正弦曲線。江硯的呼吸瞬間屏住：“這是……生物鐘基因？在單細胞水平上居然能觀測到這么規(guī)律的波動？”
“不止呢！”林卷卷調(diào)出空間分布圖，“你看它的表達位置，隨著時間推移在細胞內(nèi)移動，像在跳某種舞蹈！”
兩人對著那組數(shù)據(jù)研究了整整三個小時，直到窗外泛起魚肚白才意識到餓。林卷卷從抽屜里翻出最后兩桶泡面，用燒杯煮了開水。
“江博士，你說我們能成功嗎？”她吸著泡面，突然有點忐忑，“Nature那么難，萬一……”
“沒有萬一?！苯幋驍嗨炎约和肜锏碾u蛋夾給她，“你的代碼能跑，我的實驗數(shù)據(jù)可靠，剩下的交給科學本身。”
林卷卷看著他認真的側(cè)臉，突然笑了：“對！代碼能跑就是勝利！就算這次不行，我們再改再試，總有一天能把‘時空圖譜’敲進Nature的接收列表！”
那天清晨，他們并肩站在實驗室的窗邊，看著第一縷陽光照在“時空圖譜”的黑板上。林卷卷掏出手機，拍下這一幕，設成了屏保。
“Nature副本開荒日志，Day 15?！彼谂笥讶懴逻@句話，配了張泡面和黑板的合影，“BOSS很兇，但我們的裝備也在升級。沖！”
江硯刷到這條朋友圈時，正在調(diào)試顯微鏡。他猶豫了幾秒，點了個贊，然后把自己的手機屏保，換成了那張林卷卷趴在桌上睡顏的照片。
Nature之路注定布滿荊棘，但此刻的302實驗室里，野心與信任正在悄悄發(fā)酵，像培養(yǎng)基里悄然生長的細胞，終將綻放出驚人的力量。